Die FES Kirchheim/Teck wird vom Trägerverein: „Freie Evangelische Schule Kirchheim/Teck e.V.“ geführt. Zum Trägerverein gehören Christen aus unterschiedlichen Gemeinden rund um die Teck, die die Entwicklung der Schule unterstützen. Der Freundeskreis der Schule setzt sich für die Schule mit ein.